El Síndrome de Young se asocia síntomas sinopulmonares y esterilidad. Estas alteraciones son consecuencia de la formación de un moco altamente viscoso que obstruye las vías aéreas y el epidídimo. En cambio la actividad y la estructura ciliares son normales.

Las manifestaciones respiratorias más frecuentes son las infecciones sino bronquiales recurrentes. Algunos pacientes desarrollan bronquiectasia.

La infertilidad se debe a la obstrucción de los epidídimos por secreciones espesas. El paciente conserva su función de formar espermatozoides pero éstos no llegan al líquido seminal. Recientemente se han desarrollado técnicas de microcirugía que permiten a estos pacientes tener descendencia.